バイオ個性で食べて、心と体をつなぎ、健康と幸せを手に入れるホリスティックな食事法をコーチングする、ソフィアウッズ・インスティテュート代表 公認統合食養ヘルスコーチ（CINHC）、公認国際ヘルスコーチ（CIHC）の森ちせです。
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目次
バクテリアとウイルスは違う
抗生物質は、感染症の治療のため、病原菌（バクテリア）を殺すために使われる医薬品ですが、ウイルスを不活化させることはできません。（ウイルスは生物ではないので”殺す”のではなく”不活化”と表現します）
病原菌だけでなく、ざっくりと言えば、抗生物質はバクテリア（菌類）ならほぼ何でも殺せる薬です。結果、あなたの腸内の常在「菌」、特に、善玉「菌」までも死滅させてしまうことは、もう十年以上前から知られている事実です。
そのため、抗生物質でなければ治せない病気（感染症）以外の治療には、抗生物質を処方しないよう厚生労働省は10年以上前から全国の医師に通達しています。
しかし、未だに多くの医師が風邪やインフルエンザなどのウイルス性の疾患に対して抗生物質を処方していることが、2025年7月のJAMA Health Forumに発表された、筑波大学社会医学研究グループ公共健康政策研究室による日本全国調査によって明らかにされました。
抗生物質があなたの風邪やインフルエンザを治すことはありません。一方で、確実にあなたの腸内細菌にダメージを与えます。
でも、今回は、抗生物質の話ではありません。
あなたの腸内細菌にダメージを与える、抗生物質以外の薬の話です。
腸内細菌にダメージを与える医薬品
抗生物質以外の多くの薬が腸内細菌にダメージを与えます。
抗生物質以外の薬剤が腸内細菌にダメージを及ぼすことについては、どのような薬剤による影響が大きいのかをまとめた記事を、2018年に『IN YOU』に寄稿しました。詳しくは『数多くの医薬品が腸内細菌にダメージを与えている』（クリックするとIN YOUのページが開きます）をご確認ください。
新たに、抗生物質以外の薬がどのようにして腸内細菌（常在菌）にダメージを与え、それがあなたの健康にどのような仕組みで影響を及ぼすのかが明らかにされ、2025年8月に科学専門誌『ネイチャー』に発表されました。
今回は、その論文を和訳要約してお伝えします。
なお、裏付けとなる研究論文は、最後に参考文献として一覧にしています。
医薬品で感染症になる？
あなたと共生している常在菌たち（マイクロバイオーム）は、病原菌があなたの体内に侵入することを阻害する重要な役割を担っています。
抗生物質が、このコミュニティを阻害することはよく知られていますが、抗生物質以外の薬剤も、常在菌が病原菌を排除する力に影響を及ぼします。
集団レベルのメタゲノム研究と大規模コホートの疫学解析によって、次の要因同士の関連が明らかにされています。
薬の使用が多ければ、病原菌の増加が早く、
それに伴い、消化器官の感染症の症状が加速し、
炎症が増強され症状が重くなる
つまり、薬を飲む頻度や量が多いと感染症にかかりやすくなり、かつ、重症化しやすい・・・
そんな皮肉なことって本当にあるのでしょうか！？
病原菌の増殖を促進する薬
2018年にIN YOUに寄稿した記事では、主に次の医薬品が腸内細菌にダメージを与え、病原菌の増殖を誘発するとお伝えしました。
- 抗糖尿病薬
- 代謝拮抗剤（抗がん剤、免疫抑制剤など）
- 非定型抗精神病薬（統合失調症治療薬など）
- カルシウムチャネル阻害薬（降圧剤、狭心症薬など）
今回の研究でも病原菌の増殖を促進する薬は幅広い治療薬カテゴリーに存在していることが示され、特に、次の医薬品グループに多く存在していることが明らかにされました。
- 抗喘息薬
- 抗精神病薬
- 抗真菌薬
- 抗ヒスタミン薬（抗アレルギー薬など）
- 選択的エストロゲン受容体モジュレーター
- など
選択的エストロゲン受容体モジュレーター（SERM）とは、エストロゲン受容体に結合して作用する薬の一種です。例えば、骨に対してはエストロゲン作用があり骨密度を増加させますが、乳房や子宮に対してはエストロゲン作用を阻害し、乳がんや子宮体がんのリスクを低減するように作用する薬です。
閉経後の骨粗しょう症の改善や乳がん・子宮体がんの術後の治療に用いられる薬です。
もちろんこれらの薬剤には、抗生物質のような広範な抗菌作用はありません。腸内の常在菌に変化を引き起こすことで、病原菌の侵入を阻害する常在菌の力が弱体化すると考えられています。
殲滅（せんめつ）ではなく、力を削ぐ
病原菌の増殖に影響を与える要因
病原菌がどれくらい増殖するかは、薬剤によってどの常在菌がどれくらい影響を受けるかに因ります。
特に、次の２つの条件によって、病原菌の増殖に違いが生じます。
・・・・
常在菌と病原菌の薬剤耐性
常在菌に及ぼす変化とは
全ての医薬品は潜伏病原菌を増やす
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